Yosemite🚐

Sunday, March 22

말도 안 되게 좋았던 하루. 꼭두새벽부터 이동해야 하는 게 마냥 쉽지는 않았지만, 정말 대만족이었다. 요즘 연구 주제가 이리 뛰고 저리 뛰어서 걱정이 많았는데, 장엄한 바위들을 보고 있으면 그냥 현실이랑 분리되는 것 같기도 하고, 마음이 한결 편안해지는 걸 느꼈다. 물론 날도 아주아주 좋았고, 얘들이랑 함께해서 더 좋았던 것도 있지만, 가이드분이 그리 많지 않은 시간에도 일정을 알차게 잘 짜주셔서 더 잘 다녀올 수 있었다고 느낀다. 모든 장소에서 입이 딱 벌어지긴 했지만, 굳이 최고를 꼽자면 역시 El Capitan. Free Solo를 들어본 사람이라면 이 암벽 앞에 (완전 가까이 가지도 못했음에도) 가면 그게 얼마나 말도 안 되는 건지 느낌이 올 거다. 가이드분이 망원경을 준비해주셔서, 당시 실제로 등반하고 있는 등반가들도 볼 수 있었다(물론 로프가 있다 ㅎㅎ). 요즘 너무 징징됐던 것만 같은데 뭐랄까 이런 건 사실 별일 아니라는 생각도 들면서 환기가 되는 시간이었다. 돌아올 때는 뭐 기절하듯이 차 안에서 자면서 SF로 돌아왔다. 저녁은 Hamburger Project (808 Divisadero St, San Francisco, CA 94117)에 갔는데 오, 맛있었다. 3.5에서 4점은 줄 만한? 마지막으로는 UCSF를 간단하게 구경시켜줬다. 현욱이랑 정서 둘 다 포닥을 생각하고 있는데, 여기는 면역학도 좋은 걸로 알고 있어서 이왕이면 서부로 왔으면 좋겠다!

It was an unbelievably great day. Having to leave before dawn wasn’t easy, but it was totally worth it. Lately I’ve been worried because my research direction keeps jumping all over the place, but staring at those massive, majestic cliffs made me feel almost disconnected from reality in a good way. I could literally feel my mind settle down. The weather was perfect, and being with my friends made it even better, but I also think we had such a good trip because our guide planned the schedule so efficiently. Every stop was jaw dropping, but if I had to pick one highlight, it’s definitely El Capitan. If you’ve heard of Free Solo, then even standing in front of that wall (we weren’t even that close) makes you realize how absurdly insane that climb is. Our guide brought a telescope, so we could even see climbers on the wall at that moment (with ropes, of course). I’ve been whining a lot lately, but today reminded me that a lot of those worries are not the end of the world. It was exactly the kind of reset I needed. On the way back, I basically passed out in the car and slept all the way to SF. For dinner we went to Hamburger Project (808 Divisadero St, San Francisco, CA 94117), which my friends said Epik High mentioned, and it was actually really good. I’d give it a 3.5 to 4 out of 5. Finally, I gave them a quick UCSF tour. Both 현욱 and 정서 are thinking about doing a postdoc, and since UCSF is strong in immunology, I honestly hope they end up coming to the West Coast.

Monday, March 23

당일치기로 요세미티를 다녀와서인지 뭔가 꿈만 같은 느낌인데, 그래도 운동도 잘 다녀오고 출근도 잘 했다. 랩미팅 이후에 Kevan과 또 얘기를 했는데, 결국 하루만 더 생각해보고 그래도 답이 안 나오면 aim1을 사실상 포기하는 걸로 결론을 냈다. 사실 이걸로 모든 게 해결되는 건 아니고 다른 방안을 찾아야 하지만, 일단은 앞으로 한 발짝씩은 나가고 있는 것 같아 다행이다. 한참 다른 방안들을 좀 생각해보고, 일찍 퇴근해서 정서, 현욱이랑 러닝을 하러 갔다. 끝나곤 마지막으로 저녁도 같이 먹었는데 고맙게도 요즘 느끼는 고민에 대해 얘들이 잘 들어주고 같이 생각을 해줬다. 한국에서는 꽤나 인기가 많다던(정말인지는 모름) 트조 미니백을 쥐어 보내며 인사를 했다. 겨울에 한국 갈 때 또 볼 거라 많이 남지는 않았지만, 금방 가는 것 같아 못내 아쉬운 건 어쩔 수 없다…

Maybe because Yosemite was just a day trip, it still feels kind of unreal, but I still managed to work out, go to work, and keep my routine. After lab meeting, I talked with Kevan again. We decided to think for one more day, and if we still can’t find a solution, we may have to basically give up Aim 1. That doesn’t solve everything, and we’ll need another approach, but at least it feels like we’re still moving forward step by step. After thinking through alternatives for a while, I left early and went running with 정서 and 현욱. After the run, we had dinner together one last time. I really appreciated that they listened to my current worries and thought through things with me. I sent them off with the Trader Joe’s mini tote bag that people in Korea supposedly love (not sure if that’s actually true?). We’ll probably see each other again when I go to Korea in winter, so it’s not like this is a “goodbye forever,” but it still felt a bit sad.

Tuesday, March 24

Maggie랑 완전히 thesis를 pivot하는 것에 대해 얘기를 해보고, 결국은 기존의 aim2를 쪼개서 aim1까지 만드는 방안으로 proposal을 한 번 써보는 것으로 결론을 내렸다. 그로써 채워 넣어야 하는 디테일이 많은데, aim2는 최근에서야 thesis에 포함시킨 것이라 오늘은 논문을 읽고 어떻게든 초안을 써보는 것에 시간을 썼다. Kevan은 다행히도 이 아이디어를 좋게 생각해줬고, Bill과의 3자 미팅도 드디어 30일에 잡혀서 그때까지 논리와 자료를 잘 준비하려고 한다.

I talked with Maggie about fully pivoting my thesis, and we concluded that I should try writing a proposal that splits Aim 2 and uses part of it as Aim 1. That means there are a lot of details I need to fill in, and since Aim 2 was only recently added to my thesis plan, I spent today reading papers and trying to draft something, somehow. Fortunately, Kevan also reacted positively to the idea, and the three person meeting with Bill is finally scheduled for the 30th. I’m going to prepare the logic and materials carefully until then.

Wednesday, March 25

새로운 thesis는 방향성은 있지만, 구체적으로 어떻게 실험을 할 건지는 전혀 생각이 되어 있지는 않아서 계속 논문을 읽으며 proposal을 수정했다. 지금까지 해왔던 게 완전 수포로 돌아가는 건 절대 아니지만, 새로 시작하는 거라 시간이 많이 필요하다. 일단 양해를 구해 practice qual도 한 주 미뤘고, CCB RIPS도 2학년 마지막 순서로 미뤘다. Shokat lab에는 나 포함해서 여섯 명이 자격시험을 치러야 해서 요즘 미팅은 거의 practice가 대부분인데, 친구들이 최선을 다해 생각한 board와 발표, 그리고 다른 사람들의 피드백을 들으니 나도 어떻게 준비해야 할지에 대한 굉장히 좋은 정보를 많이 얻어가는 것 같다. 특히 질문이 들어왔을 때 답에 시간이 좀 걸릴 것 같다면, 일단 질문을 칠판에 그려내는 것이 여러모로 참 좋은 전략인 것 같다.

The new thesis direction has a general shape, but I still don’t have a concrete experimental plan at all, so I kept reading papers and revising the proposal. What I’ve done so far is definitely not wasted, but it still feels like starting over, and that takes time. I asked for permission to push my practice qual by one week, and I also moved my CCB RIPS talk to the last slot among second years. In the Shokat lab, including me, six people have to take the qual, so most meetings lately are basically practice sessions. Watching my cohort’s carefully prepared boards and talks, and listening to everyone’s feedback, is giving me a lot of useful information about how I should prepare. One strategy I especially liked is that if a question is hard and you need time to think, drawing the question on the board first can be a really good move.

Thursday, March 26

오늘도 하루종일 논문 읽고 디테일을 정리했다. 바뀐 proposal의 가장 중요한 논문들이 이제 몇 개 안 남았고, 방의 두 대학원생들이 전 postdoc과 함께 썼던 논문이 그 중 하나여서 오늘 그 둘과 여러 의견을 나눴다. 고맙게도 내 현 상황에 대해 격려의 말을 많이 해줬고, 구체적으로 필요한 실험들에 대해서도 같이 생각을 해줬다(Thanks Vickie, Micah!). 오후에는 Kevan의 seminar 이후로 종빈이와 함께 코스트코를 다녀왔다. 이 와중에 밥은 또 잘 챙겨 먹으려고 열심히 노력 중이다… 운동이라도 잘 되고 있어서 다행이라 해야 할지.

I spent the entire day again reading papers and organizing details. There are only a few key papers left that are central to the updated proposal. One of them was written by two graduate students in our lab with a former postdoc, so I talked with them today and discussed various points. I’m really grateful because they encouraged me a lot and also helped me think through concrete experiments I might need (Thanks, Vickie and Micah!). After Kevan’s seminar in the afternoon, I went to Costco with Jongbin. I’m also trying hard to keep eating properly through all of this. At least my workouts are still going well, so I guess that’s something.

Friday, March 27

이제 구체적인 아이디어들이 좀 잡혀나가고 있는데, 모든 proposal이 그렇듯이 파고들수록 역시 더 읽어야 하는 논문들이 늘어나서 걱정이다. 근데 지금은 사실 자격시험을 통과하는 게 급선무니까 어느 정도 수준에서 일단 만족하고 마무리를 해야 할 듯하다. 오늘 내 뒷자리에 앉은 Chet(나랑 qual date가 4월 27일로 똑같다)의 practice qual에 참석하고, 이후에는 중국에 있는 Bill과 시간이 맞아 아주 짧게 15분 정도 미팅을 할 수 있었다. 다행인 부분은 새로운 aim2를 좋아하신 것. 하지만 시간이 없어서 현재 aim1이 지난 몇 주 동안 어떻게 변해왔으며(중요한 부분을 포기하기로 한 것), 결국 aim2를 확장해서 다시 thesis를 reframing해야 하지 않을까라는 의견에 대해 깊게 같이 생각해보지는 못했다…

My ideas are becoming more concrete, but like any proposal, the deeper I go, the more papers I realize I still need to read, which is stressful. But honestly, passing the qual is the top priority, so I probably need to stop at some point and accept “good enough” so I can finish. Today I attended Chet’s practice qual (he sits behind me, and his qual date is the same as mine: April 27). Later, the timing worked out and I was able to have a very short 15 minute meeting with Bill in China. The good news is that he liked the new Aim 2. But since we had so little time, we couldn’t really discuss how Aim 1 has changed over the past few weeks, including the decision to give up an important part, and whether we should expand Aim 2 and reframe the entire thesis around a single theme.

Saturday, March 28

논문을 열심히 읽어나가는 것과 더불어, 내일 Bill과 꽤 오랜 시간 논의를 할 수 있게 되어서 예전에 했었던 thermodynamic calculation 결과부터 지금까지 어떻게 thesis가 무슨 이유로 어떻게 변해왔는지 자료를 쭉 정리했다. 그리고 감사하게도 다음 주에 qual committee 중 두 분과 각각 화요일, 금요일에 미팅을 하게 되어서 현 상황을 어떻게 설명하고 어떤 부분에 대해 조언을 받으면 좋을지에 대해 생각했다. 뭔가 하루빨리 딱, 모두가 동의할 법한 주제로 딱 정해졌으면 좋겠다.

Along with continuing to read papers, I organized a full set of materials because I will be able to have a longer discussion with Bill tomorrow. I summarized everything from my earlier thermodynamic calculations to how and why the thesis direction has changed up to now. I’m also grateful that next week I have meetings with two of my qual committee members, on Tuesday and Friday, so I thought carefully about how to explain my current situation and what specific advice I should ask for. I really wish I could lock in a topic that everyone would agree on as soon as possible.