A Pilot Run!
Sunday, January 25
느지막하게 잠을 잔 후 운동을 다녀오고, 실험실 다녀오고, 코스트코 갔다가 밀프렙하고 청소하니 정말 하루가 다 가버렸다.. 평일에는 아침 다섯 시 반에 일어나야 하다 보니, 보통 열 시 전에는 꼭 누우려고 한다. 확실히 나는 잠을 푹 자면 컨디션이 좋은 게 몸으로 느껴지기에 가끔은 좀 더 뒹굴고 싶을 때가 많은데 잘 참아?보고 있다. 근데 그것보다는 저녁에도 러닝을 조금이라도 뛰면 훨씬 잠이 잘 오는 것 같아서 그렇게 하고 있는데 확실히 효과가 좋다. 어떤 이유에서든지 일찍 잠에 들고 싶은 마음이 있다면 (물론 그러지 못하는 상황이 있을 때가 많지만서도) 잠자기 여유롭게 두 시간 전쯤에 가볍게 러닝을하고 따뜻한 물에 씻으면 꽤 도움이 될 거로 생각한다.
slept well, then went to the gym, stopped by the lab, swung through Costco, meal-prepped, and cleaned. The whole day disappeared. Since I need to wake up at 5:30 on weekdays, I try to be in bed before 10. I can feel in my body how much better I function after solid sleep, so even when I want to lounge a little longer, I try to resist. What helps even more than sheer willpower is a short evening run. I fall asleep much faster when I jog a little about two hours before bed, then take a warm shower. If anyone wants to sleep earlier, I think that combo can help, schedule permitting.
근래는 조금씩 체중을 불리고 있어서 조금 탄수화물에 대해 관대?해졌는데 ㅋㅋ 지방은 뭐 올리브오일이나 버터, 견과류 등등 굉장히 편한 방법으로 채울 수 있는데 탄수는 정말 딱 잘 챙겨 먹기가 쉽지가 않아서 (단백질도 생각보다 채우기가 쉽다) 혹시나 괜찮은 시리얼이 있는지 봤다. 세 번째 사진에 있는 Cheerios가 생각보다 엄청 성분이 좋아서 (39g에 지방 2.5g 탄수 29g, 단백질 5g 정도)! 얘를 업어왔는데, 맛도 적당히 삼삼하고 어디든 곁들여 먹기가 좋다. 모양도 귀엽고 ㅎㅎ 다시 달걀도 먹어보려고 하고, 조금은 더 맛있게 식단을 해보려 한다.
I am trying to slowly increase my weight again, so I have become more relaxed about carbs. Fat is easy to hit with olive oil, butter, and nuts, and protein is not that hard either, but carbs are surprisingly tricky to get just right. I looked for a decent cereal and found that Cheerios are better than I expected for the ingredients and macros: about 39 g serving with 2.5 g fat, 29 g carbs, and 5 g protein. The taste is mild, it goes well with almost anything, and the little heart shapes are cute. I am also having eggs again. The goal is to keep the diet a bit tastier while staying on track.
Monday, January 26
gym은 여섯 시에 여는데, 난 보통 다섯 시 반에 일어나서 집에서 몸을 쭉 풀고, 가볍게 귤 하나 우유 조금, 카페인 알약을 먹고 여섯 시쯤에 딱 도착하려 한다. 보통 5분에 도착하는데 어느 날은 조금 일찍 여섯 시 전에 도착한 적이 있었다. 근데 참 대단한 게 벌써 20명 넘는 사람들이 밖에 줄을 서 있는 게 아닌가… 그리고 대부분은 내가 gym에 올 때마다 있는 사람들이었다. 솔직한 마음으로는 몇몇 붙잡고 한 번 물어보고 싶었다 평소에 어떻게 사는지 ㅋㅋㅋ 뭐랄까 잠을 선천적으로 적게 자는 게 아닌 이상 그들도 일찍 잠에 들어야 할거고, 꾸준히 유지하려면 많은 것들을 포기하면서 살아야 할 텐데 말이다. 난 이런 생활을 쭉 하다 보니 (더 일찍 일어난 건 얼마 되지 않았지만) 오히려 지금은 이게 썩 좋은 거라고 자신 있게 말하기가 힘들다. 저녁 약속 가기도 부담스러워지고. 지금은 동기부여가 잘 되어있어서 자기 전에 조금은 설레는 마음이 있어 벌떡벌떡 잘 일어나지지만, 몸이 안 좋거나 일에 치이는 날에는 아무래도 쉽지 않을 텐데. 뭐, 하여튼 서로 인사는 안 해도 그 자리에 계속 있는 사람들의 존재로 인해 조금 더 힘이 나는 게 있어서 감사하다.
The gym opens at six. I usually wake up at 5:30, stretch at home, and have a small pre-workout snack: a tangerine, a little milk, and a caffeine pill. I try to arrive right around six, usually at :05. One day I got there a bit early and there were already more than twenty people lined up outside. Most of them are the same faces I see every time. Part of me wanted to ask a few of them how they live. Unless they naturally need very little sleep, they must go to bed early and give up a lot to keep this routine. After living like this myself, even though the very early wake-up is recent, I cannot say with confidence that it is always good. Evening plans feel heavier. Right now I am motivated, so I go to bed a little excited and I pop up easily. On days when I am not feeling well or when work piles up, it will not be so easy. Still, even if we never say hello, the fact that those people keep showing up gives me a little extra energy. I am grateful for that.
요즘 또 드는 생각은 실험이라는 게 나랑 어떤 면에서는 참 잘 맞지 않고 어떤 면에서는 참 잘 맞는다는 것. 내가 서른이 넘었으니 나에 대해 완벽하진 않더라도 어느 정도는 어떤 놈인지 대강은 알게 되었다고 생각하는데, 나는 예상대로 일이 흘러가지 않는 것에서 스트레스받는 편이다. 근데 대학원에서는 당연히 예상대로 흘러가지 않을법한? 일을 하는 게 보통이고 (이미 그 자체로 뻔하고 100% 될만한 것들은 대개 thesis project로 하지는 않으니…?) 실패의 연속인데 그래서 참 스트레스를 많이 받는다. 근데 그렇다고 이게 마냥 싫다라기엔 참 어려운 게, 그걸 또 어떻게든 발버둥 쳐서 고민하고 나름의 답을 찾아내어 극복하면 그게 또 굉장히 기분이 좋다. 이 부분은 같은 걸 하염없이 계속 반복하기만 하는 일을 선호하지 않는 또 나의 다른 성향에서 비롯되지 않았나 싶다. 사실은 좋은 환경에서 큰 걱정 없이 내가 하고 싶은 걸 하고 있다는 점에서 항상 감사해야 하는 건 맞으나, 고통스러울 때가 있는 건 어쩔 수 없는 것 같다 ㅋㅋㅋ…. 특히 가끔 한국에 있는 친구들과 연락하다 보면 (특히 결혼 소식이 많이 들린다. 다들 축하해), 내가 내린 선택의 기회비용에 대해서 계속 파고들게 되는듯한데, 그럼에도 지금 선택이 나라는 사람에게는 최선이었다고 생각을 한다. 해볼 건 다 해보고, 하지만 아무래도 빨리 졸업했으면 좋겠다😅
Lately I keep noticing that experimental work both suits me and does not. I am past thirty now, so even if I do not know myself perfectly, I have a decent sense of who I am. I get stressed when things do not go as planned. In grad school, work is almost defined by not going as planned, since obvious and guaranteed projects rarely become a thesis. That means lots of failure, which is tough for me. At the same time, I cannot say I dislike it. When I wrestle with a problem, think it through, find a workable answer, and get past it, that feels really good. I probably like this because I do not enjoy doing the exact same task over and over. I am also aware that I am lucky to be in a good environment where I can pursue what I want without major worries, although there are still painful moments. Sometimes I catch up with friends in Korea, and lately I have been hearing many wedding announcements (Congrats🎉). I start thinking about the opportunity cost of the path I chose. Even so, I believe this path is the best fit for me. I want to try everything I can, do it properly, and, honestly, I hope I can graduate soon😅
Tuesday, January 27
운동을 마치고 대략 오전 일곱 시쯤에 되면 저렇게 예쁜 하늘이 맞아준다. 은근히 아무 생각 없이 바라보고 있다 보면 왜인지 힘이 나는 게 신기하다. 오늘은 DeGrado Lab에 계신 한국인 박사님이 좋은 소식이 생기셔서 아침부터 기분이 좋았다. 괜찮다고 생각하는 사람들이 잘 되는 걸 보면 나도 참 기쁘다.
The sky looks so beautiful around seven in the morning when I finish my workout. It is funny how just staring at it with an empty mind gives me energy. A Korean postdoc in the DeGrado Lab got good news today, so my mood was bright from the morning. When good people do well, I feel genuinely happy too.
저번 주 화요일부터 DeGrado lab postdoc과 check in meeting을 하고 있는데, 아주아주 도움이 된다. 솔직히 한 주 동안에 있었던 일들을 전부 가감 없이 밝혀야 하는 것이라 조금은 부담스럽기도 하지만 굉장히 똑똑한 친구라 대화가 즐겁고 자극도 많이 된다. 다음 주에는 이 친구의 연구도 한 번 들어보기로 했다 ㅎㅎ
Since last Tuesday I have been doing a weekly check-in with a DeGrado lab postdoc, and it has been incredibly helpful. To be honest, it is a little stressful because I have to lay out everything that happened during the week without filtering, but she is very smart, the conversation is fun, and I get a lot of motivation. Next week I will also listen to her research.
오늘은 어제 잘 안됐던 실험이 있어서 이걸 어떻게든 살려보고자 하나의 실험을 더 했는데 하하…. 잘 안됐다. 음.. 이게 참 어려운 게 어떤 실험을 새로 할 때 그에 대한 모든 작동 원리를 파악하고 하자는 게 내 지론이었는데, 이게 프로젝트가 여러 개고 일이 많아지다 보면 일단 다른 사람이 한 대로 해보고 문제가 생기면 Troubleshoot을 하는 게 나을 수도 있다는 생각도 들어서 요즘 그렇게 하고 있었는데, 역시나 그러면 또 생각하지 못한 문제가 여럿 생긴다 (심지어 나에게 알려줬던 사람도 전혀 생각하지 못한). 그래서 여유가 된다면 역시 내 자신도 확신을 갖고 실험을 설계하는 게 최선이지 않을까 싶다. 시간이 너무 부족하고 실패의 위험이 크지 않다면 후자의 방법도 물론 좋고. 그게 정확히 필요한 부분을, 빠르게 배울 수 있다는 방법이라는 것은 부정할 수 없는 것 같다.
One of yesterday’s experiments did not go well, so I ran one more to try to rescue it, but it still did not work. This is tricky. My principle has been to fully understand the mechanism before starting a new experiment. But when projects stack up, sometimes it seems better to first follow what someone else did and then troubleshoot if problems arise. The issue is that unexpected problems show up, including ones the person who taught me did not anticipate. If time allows, the best path is still to design the experiment myself so I can run it with confidence. If time is short and the risk is low, the copy-then-troubleshoot route can be a fast way to learn the exact parts that matter.
또 오늘의 마지막 이벤트? 라면 내가 맡은 shokat lab에서의 lab job이 있겠다. 나는 웹페이지 관리를 맡았는데, 엄밀히 말하면 최근에 넘겨받게 되었지만, 지금까지는 우리가 정보 업데이트를 해야 하면 외부 관리자에게 대신 push를 해달라고 부탁해야 해서 굉장히 번거로운 시스템상의 문제와 도메인 관리 문제가 겹쳐서 한두 달을 이것저것 의논하고 IT에도 왔다 갔다 했었다. 다행히 지금은 전부 다 잘 해결되어, github page를 이용하고 권한을 받아 내가 그때그때 수정할 수 있게 변경이 됐다. 더 꾸미고 싶은 생각은 없고, 업데이트 요청이 오면 그때그때 대응하는 정도로 그냥 만족하려고 한다 ㅎㅎ.. 굳이 관심이 없는 사람들도 많고.
My last item today was my Shokat lab job. I took over website maintenance recently. Until now, whenever we needed to update information we had to ask an external manager to push changes, which was inconvenient. There were also some domain management complications, so we spent a month or two discussing options and going back and forth with IT. Thankfully everything is solved now. We moved to GitHub Pages, I have the right permissions, and I can make edits whenever needed. I do not plan to decorate the site much. I will just handle updates as they come in.
저녁에는 항상 머리를 같이 자르러 가는 An이라는 친구와 저녁을 먹으면서 이 친구의 thesis project에 대해서 dicussion을 했다. 물론 이 친구가 원하기도 했지만 내가 너무 비판적인 입장에서만 의견을 제시하지 않았나 좀 후회가 되는 점도 있다. 다음에는 좀 북돋아 주는 말도 해보려고 노력해야지….
In the evening I had dinner with my friend An, who always gets haircuts with me, and we discussed his thesis project. He asked for it, but I still regret that I may have been too critical. Next time I want to make sure I also say things that encourage him.
Wednesday, January 28
오늘은 특별한 일은 없었고 그냥 일이 많아서 열 시가 되어야 퇴근했다. 솔직히 말하면 그냥 일찍 마치고 조금 늦더라도 내일 할 수 있었을 텐데, 조금 욕심을 부려 밀어붙였다. 이게 장기적으로 보면 내일 아침에 또 일찍 일어나는 걸 힘들게 하고 컨디션도 안 좋게 할 수 있어서 막 좋진 않은 것 같은데 (특히 피치 못 하게 늦게까지 일하는 게 아닌 이상), 좀 자제를 더 해보려고 해야겠다. 박사 자격시험 전까지는 빨리빨리 하고 싶은 마음이 강해서 쉽지가 않은 것 같은데, 그 이후에는 정말 최대한 무리하지 않으려고 한다. 내 일을 조절할 수 있다는 게 또 이 환경의 가장 큰 장점이기도 하니까. 아 말을 못 했는데 이틀 전에 다시 자격시험 일정이 잡혔고, 다행히도 너무 늦지는 않은 4월 27일에 보게 되었다. 3월 말에 친구들이 샌프란시스코 오는데 그때 다행히 편하게 같이 놀러 갈 수 있게 됐고, 5월 중순에 가족이 올 때도 휴가 내고 같이 시간 보낼 수 있을 것 같아서 좋다.
Nothing special happened today. I just had a lot of work and did not leave until 10 p.m. Honestly, I probably could have wrapped up earlier and finished the rest tomorrow, even if it meant starting a bit later, but I got ambitious and pushed through. In the long run that makes it harder to wake up early and leaves me feeling off the next day, especially when working late is not unavoidable, so I should hold back a bit. It is hard because I want to move fast before the qualifying exam, but after that I really want to avoid overdoing it. Being able to control my own schedule is one of the biggest advantages of this environment. I forgot to say this earlier, but my qual date was reset two days ago. Thankfully it is not too late: April 27. Friends are visiting San Francisco at the end of March, so I can relax and spend time with them, and my family will come in mid May, so I should be able to take time off and enjoy that too. I am happy about that.
Thursday, January 29
오늘도 실험 말고는 딱히.. 하루하루 많은 것들을 배우고 있다. 또 Side Project를 하나 맡게 되었는데 또 새로운 assay, 접근 방법을 치열하게 공부해야 하니 시간이 많이 들어간다. 마음 같아서는 내 것만 하고 싶은 마음이 강한데 ㅋㅋㅋ 뭐 잘해봐야지. 내가 요즘 가장 공을 들이고 있는 부분은 작년에 preprint로 나온 protocol을 우리 랩의 실정에 맞게 reproduce하는 것인데, 오랜 준비 끝에 드디어 pilot run을 곧 할 수 있을 것 같다. 기대된다.
Not much besides experiments today. I am learning a lot every day. I picked up another side project, so I need to study a new assay and approach in depth, which will take time. Part of me wants to focus only on my own project😛, but I will make it work. Lately my main push has been adapting a protocol from a preprint last year to fit our lab. After a lot of preparation, it looks like I can finally run the pilot soon. I am excited.
Friday, January 30
오늘 운동 끝나고 찍은 사진인데, 근래 본 하늘 중 가장 예뻐서 (도대체 색이 몇 개인가? 진짜 멍하니 바라보게 된다) 파란불에 살짝 멈춰서 바라보다 찍어보았다. 언젠가 여기서도 끝내주는 일출을 제대로 보러 가야 할 텐데. 오늘 뭐 실험 열심히 한 것 말고는 딱히 별일이 없다. 요즘은 일부러 운동을 아침에 다 하지 않고 저녁에 나눠서 (50분, 20분) 하고 저녁에 러닝을 추가로 뛰고 있어서인지 퇴근하고 다시 운동가고 저녁 먹고 씻고 하면 곧 자야 한다. 아침에 너무 밀어붙이는 게 피곤했는데, 나눠서 하니까 확실히 좀 더 뒤 운동들도 강도 있게 되고 러닝도 빼먹지 않게 되어서 지금까지는 잘 맞는 방법인 것 같다. 특히 일이 잘 안 풀렸을 때 집에서 뻗고 싶을 때도 있는데 어떻게든 나가게 해주는 것 같기도.
After my workout I snapped a photo of the sky. It was the prettiest I have seen in a while, with so many colors that I paused at a blue light just to stare for a moment. I should plan a proper sunrise trip here someday. Nothing special besides working hard at the bench today. Lately I split training between morning and evening, about 50 minutes plus 20 minutes, then add a run at night. After work I head back to the gym, eat dinner, shower, and then it is almost bedtime. Pushing everything into the morning was tiring, but splitting sessions keeps the later workouts intense and helps me avoid skipping the run. It also gets me out of the house even when I want to crash after a rough day.
Saturday, January 31
드디어 오늘 열심히 준비했던 protocol의 pilot run을 했다. 누가 보면 코웃음 칠 수 있겠지만, 나름 치열하게 고민해서 있는 장비 없는 장비 끌어모아서 했는데, 잘 진행되고 있는 것 같다. Plate shaker에 temperature control 기능이 있는 건 무지하게 비싸고 가지고 있지 않아, 임시방편으로 마련한 shaker 안에 넣고 밖으로 플러그를 빼서 DIY로 만들어 보았다. 다음 주쯤에는 결과가 나올 텐데 기대된다.
I finally ran the pilot for the protocol I have been preparing. Some might laugh at it, but I pulled together every piece of gear I could and thought through the details, and it seems to be running well. Since a temperature-controlled plate shaker is quite expensive and we do not have one, I improvised a DIY setup by placing the plate shaker into an incubator and routing the power cable outside. I should have results next week, and I am excited to see them.
