Locked in
Sunday, April 19




종빈이와 오늘도 러닝을 하고 (드디어 9.5 miles!), 역시 하루 종일 내일 제출해야 하는 proposal을 수정했다… 글을 쓰는 게 직업인 작가분들은 어떤 루틴을 지키면서 하루하루 글을 써나갈지 참 궁금해졌다. 여러 팟캐스트에서 듣기로는 절제된 삶을 살려고 치열하게 노력하거나 그냥 기분 가는 대로 살거나, 극과 극인 예시들만 들어왔는데 실제로도 과연 그럴지…
I went running with 종빈 again today, and we finally reached 9.5 miles! After that, as expected, I spent the whole day revising the proposal I need to submit tomorrow… It made me wonder what kind of routines professional writers follow as they write every day. From several podcasts, I have only heard extreme examples, either people who try very hard to live a disciplined life or people who simply live based on how they feel. I wonder if that is actually true in real life too…
Monday, April 20


드디어 proposal을 잘 마무리해서 보냈다. 오후에 잠깐 한국에서 오신 postdoc candidate과의 meeting에 참석했고, 이후에는 오늘 동기 친구 두 명과 함께 동기들 앞에서 practice talk을 했다. 오늘로 딱 1주일 남았는데, 아직 완벽하진 않지만 준비가 나름 잘 되어가고 있다고 느낀다. 수요일에 마지막 practice talk이 있는데, 아무래도 protein design을 잘 아는 포닥과 대학원생 앞에서 하는 거라 준비가 더 필요하다!
I finally wrapped up the proposal and sent it out. In the afternoon, I briefly attended a meeting with a postdoc candidate visiting from Korea, and afterward, I did a practice talk in front of my cohort with two of my classmates. As of today, exactly one week is left. It is not perfect yet, but I feel like the preparation is going pretty well. I have my final practice talk on Wednesday, and since I will be presenting to postdocs and graduate students who know protein design well, I definitely need to prepare more!
Tuesday, April 21
오늘은 많이 미뤄왔던 ㅎㅎ Tanja의 최근 paper 중에서 내 연구 주제와 많이 관련된 것들을 뽑아 쭈욱 읽었다. 잘 쓰인 논문을 볼 때마다 느끼는 것은, 깊이가 참 중요하다는 것이다. 수년 동안 같은 분야를 파다 보면 이제 어느 정도 논문의 흐름이 보이고, 용어도 익숙해지고 뭐가 중요한 문제인지 알 테니, 본인의 연구 방향도 그만큼 날카롭게 다듬어질 수 있을 텐데… 그렇지 않고 이것저것 겉핥기로 공부하다 보면 사실상 중요한 부분을 놓치게 되는 것 같다. 물론 요즘 agent의 도움으로 습득 속도가 비약적으로 늘어났다고는 하지만, 깊은 이해에서 나오는 통찰은 쉽게 학습되지는 않는 것 같다고 여전히 느낀다. 지금 내 proposal은 사실 두 개를 한 개로 어찌어찌 잘 합쳐놓은 모양새이고, 박사과정생 혼자서 할 수 있을지에 대한 우려 섞인 의견도 종종 받긴 하는데.. 퀄 끝나고 어디에 힘을 줘야 할지 명확한 방향 설정이 필요하다고 느낀다. 저녁에는 종빈이가 practice talk을 해서 참석했고 (잘한다!!), 역시 언제나 빠지지 않고 운동을 간 후 하루를 잘 마무리했다.
Today, I finally read through several of Tanja’s recent papers that are highly related to my research topic, something I had been putting off for a while. Whenever I read a well-written paper, I feel that depth really matters. If you spend years digging into the same field, you start to understand the flow of papers, become familiar with the terminology, and know what the important problems are. That probably helps sharpen your own research direction. But if you only study many things superficially, I think you end up missing the truly important parts. Of course, with the help of agents these days, the speed of learning has increased dramatically, but I still feel that insight from deep understanding is not something you can easily acquire. My current proposal is honestly shaped like two projects somehow merged into one, and I sometimes receive concerned comments about whether one PhD student can actually do all of it… So after the qual, I feel that I will need to clearly decide where to put my energy. In the evening, I attended 종빈’s practice talk, and he did great!! Then, as always, I did not skip the gym and wrapped up the day well.
Wednesday, April 22
내 동기의 DGL group meeting이 끝나고 (이 친구도 내 시험 3일 뒤에 자격시험을 봐서 그룹 미팅을 chalk talk 스타일로 했다), 열심히 board 준비를 해서 오후에 내 마지막 practice talk을 잘 마쳤다. 전체적으로 feedback이 좋았고, 이제는 정말 준비가 된 느낌을 받는다. 그래도 언제나 여전히 부족한 부분이 있기 마련이라 남은 기간 잘 준비해보려 한다.
After my cohort member’s DGL group meeting, which he did in a chalk talk style because his qualifying exam is three days after mine, I worked hard to prepare my board and successfully finished my final practice talk in the afternoon. Overall, the feedback was good, and now I really feel like I am ready. Still, there are always parts that can be improved, so I will use the remaining time to prepare well.
Thursday, April 23





오늘은 종빈이와 윤서 누나와 함께 (다들 각자 할 일에 조용하게 잘 집중하는 게 내 스타일이다 ㅎㅎ) 스벅으로 또 향했는데 점심 먹으러 근처에 있는 Timber + Tide (685 Gateway Blvd, South San Francisco, CA 94080)라는 곳으로 갔다 (내가 시킨 생선을 포함해 메뉴도 다양했고 가격도 나쁘지 않았다). 회사 근처라서 그런지 (내 꿈의 회사들이 있다.. Genentech, Amgen, AbbVie 등등), 랩탑 들고 공부하는 느낌으로도 많이 사용하는 것 같았고, 널찍널찍하고 창도 시원하게 나 있어서 여기서 식사하고 기분 좋게 나머지 시간을 집중했다. 이것저것 논문을 많이 읽었고, 최근까지 받았던 피드백을 한자리에 모아 깔끔하게 정리했다. 얼마나 내용을 많이 알고 있는지도 중요하지만, 지금까지 여러 연습을 보고 해본 결과, 전혀 처음 듣는 내용이라도 질문을 듣고 어떻게 논리적으로 답변할 수 있는지가 중요한 것 같다. 파편화된 지식을 얼마나 잘 모아서 답을 만드는지뿐만 아니라, 그 답을 향해 나아가는 태도?도 아주 중요하다고 느꼈다. 좀 지치는 과정이긴 하지만 여러모로 많이 배울 수 있어서 좋다.
Today, I went to Starbucks again with 종빈 and 윤서 (I like them; everyone quietly focuses on their own work). For lunch, we went to a nearby place called Timber + Tide at 685 Gateway Blvd, South San Francisco, CA 94080. Maybe because it is near many companies, including my dream companies like Genentech, Amgen, and AbbVie, it seemed like many people also use it as a place to work or study with their laptops. The space was wide and open, with nice large windows, so after eating there, I was able to focus pleasantly for the rest of the time. The menu was diverse, including the fish dish I ordered, and the price was not bad either. I read quite a few papers and organized all the feedback I had received so far in one place. Of course, knowing a lot of content is important, but after watching and doing several practice talks, I feel that even when you are asked something completely new, what matters is how logically you can respond. It is not only about how well you can assemble fragmented pieces of knowledge into an answer, but also about your attitude? as you move toward that answer. It is a bit exhausting, but I like that I am learning a lot in many ways.
Friday, April 24
종종 언급했지만 금요일은 내가 가장 좋아하는 Research In Progress가 있는 날. 아주 똘망한 동기 두 명이 발표를 했는데 아… 아주 좋고 동기부여가 되는 시간이었다 (이미 둘은 자격시험을 통과하고 실험에 집중하고 있다). 나도 얼른 마무리해서 속도를 내봐야지! 수업 이후에는 Vickie (Shokat Lab 대학원생)와 coffee chat을 했는데, 랩 적응하는 것부터 여러 실험까지 신경을 많이 써줘서 항상 고마움이 있다. 특히 우리 랩이 여섯 명이나 자격시험을 봐야 해서 practice가 많았는데, 모두 참석해주고 질문을 전부 정리해서 각자에게 보내주기까지.. 천사인가.. 그래서 고마움에 스벅 기프티콘을 보냈는데, 그걸로 또 커피 같이 마시자고 제안해주는 게 아닌가! 여러모로 많은 사람들이 이 친구의 반만이라도 배려심이 있으면 좋겠다. 응원을 많이 받았고, 요즘 또 내가 혼자 A to Z까지 다 하는 걸 좀 포기하기로 마음먹어서, 본격적으로 실험을 할 때는 collaboration을 이 친구와도 많이 할 수 있을 거라는 생각을 했다.
As I have mentioned several times, Friday is the day of Research In Progress, which is my favorite class. Two very sharp classmates gave presentations, and ah… it was such a good and motivating time. Both of them have already passed their qualifying exams and are focusing on experiments. I also need to finish mine soon and start building momentum! After class, I had a coffee chat with Vickie, a graduate student in the Shokat Lab. I am always grateful because she has cared a lot about many things, from helping me adjust to the lab to thinking through experiments. Especially because six people in our lab had to take the qualifying exam, we had many practice talks, and she attended all of them, organized all the questions, and sent them individually to each person.. Is she an angel..? So I sent her a Starbucks gift card to thank her, and then she suggested that we use it to get coffee together! In many ways, I wish more people had even half of her thoughtfulness. I received a lot of encouragement, and these days I have also decided to give up on trying to do everything from A to Z by myself, so I thought that once I start doing experiments seriously, I may be able to collaborate with her a lot too.
저녁 늦게는 드디어 qual committee 중 한 명인 Tanja를 만났다. 저번 주 Jim과의 미팅처럼 예상외로 너무 잘 풀려서… 당황스러울 정도였다. 금방 끝나고 다음 주 월요일에 잘 준비해서 보자고 하셨다! 자격시험 끝나고 내가 최적화하고 있는 protocol에 대해 배울 사람을 뽑아 보내도 되냐고 해서, 좀 뭐랄까 이미 붙은 걸로 아시는 건지 헷갈릴 정도로 ㅋㅋㅋ… 여튼 방심하지 말고 잘 준비해봐야지. Protein design을 너무 잘 알고 계셔서 어떤 취약점이 있을까 걱정했는데, 잘 풀려서 다행이다.
Late in the evening, I finally met with Tanja, one of my qual committee members. Like the meeting with Jim last week, it went unexpectedly well… almost to the point of surprise. The meeting ended quickly, and she told me to prepare well and see her next Monday! She even asked if she could send someone from her lab after my qualifying exam to learn the protocol I have been optimizing, which made me wonder, in a funny way, whether she already thinks I passed…😅 Anyway, I should not let my guard down and should prepare well. Since she knows protein design so well, I was worried about what weak points she might find, but I am glad it went well.
Saturday, April 25






사실 갑자기 어제 머리를 짧게 깎아버리고 싶은 충동이 들어서, 원래는 한 달마다 미용실에 가지만 급하게 오늘로 예약을 했다. 고백하자면 아침에 일어나자마자 네 시간 넘게 haircut 유튜브를 봤다. 한참 고민하면서 계속 기를까 하다가도 그 깔끔한 짧은 머리의 유혹을 참기가 힘들다. 운동도 요즘 재미를 붙여서 잘되고 있어서 그런가..? Gym에 있는 몸이 미친 형님들을 보다 보니까 (한 명도 빠짐없이 짧은 머리를 하고 있다) 그런 것 같기도.. 결국 시원하게 또 잘라버렸다. 운동 더 열심히 해야지 ㅎㅎ 머리를 자를 때마다 최대한 가보지 않은 레스토랑을 시도하고 싶어서, Spicy King (65 Waverly Pl, San Francisco, CA 94108)라는 곳을 가봤다. Szechuan Style Mouth Watering Chicken (이름도 웃기다)이 가장 괜찮았고 대창? 볶음은 나에게는 좀 느끼했다. 그래도 3.5/5는 줄 수 있을 정도! 예약 시간까지 시간이 촉박해서 천천히 못 즐긴 게 아쉽다. 머리하고는 boba를 먹으러 갔는데, 썩 그저 그랬다. 집에서 board 준비를 좀 했는데, 아무래도 당일 아침보다는 내일 밤에 미리 완성해두는 게 나을 것 같다.
Honestly, yesterday I suddenly had the urge to cut my hair short, so even though I usually go to the hair salon once a month, I quickly made an appointment for today. To confess, as soon as I woke up in the morning, I watched haircut videos on YouTube for more than four hours. I kept debating whether I should keep growing it out, but it is so hard to resist the temptation of a clean short haircut. Maybe it is also because I have been enjoying working out more these days and things have been going well..? When I look at the insanely fit guys at the gym, every single one of them has short hair, so maybe that influenced me too..😗 In the end, I cut it short and fresh again. I should work out even harder🥹 Whenever I get a haircut, I try to visit a restaurant I have never been to before, so I went to a place called Spicy King at 65 Waverly Pl, San Francisco, CA 94108. The Szechuan Style Mouth Watering Chicken, even the name is funny, was the best dish, and the stir-fried large intestine? was a bit too greasy for me. Still, I think I can give it a 3.5/5! It was a little unfortunate that I could not enjoy it slowly because I was running short on time before my appointment. After the haircut, I went to get boba, but it was just okay. At home, I prepared my board a bit, and I think it would be better to finish it tomorrow night rather than on the morning of the exam.